測(cè)序女王:我在生物公司封神
周一的研發(fā)部例會(huì),王鵬帶來(lái)了華熙醫(yī)院的新需求:“李教授希望我們?cè)黾?00例肺癌組織樣本的全外顯子組深度測(cè)序,測(cè)序深度要達(dá)到100×,并且要求兩周內(nèi)完成所有數(shù)據(jù)交付和分析。
另外,公司總部空降了一位技術(shù)總監(jiān),明天到崗,負(fù)責(zé)統(tǒng)籌所有研發(fā)項(xiàng)目?!?br>
會(huì)議室里瞬間安靜下來(lái),有人忍不住低聲抱怨:“100例樣本,兩周時(shí)間,還要做深度分析,這根本不可能完成??!
咱們組現(xiàn)在只有兩臺(tái)測(cè)序儀,滿(mǎn)負(fù)荷運(yùn)行也得三周才能做完測(cè)序?!?br>
田甜也皺起眉。
全外顯子組深度測(cè)序?qū)颖举|(zhì)量、儀器穩(wěn)定性和數(shù)據(jù)分析能力都有極高要求,100×的測(cè)序深度意味著每個(gè)堿基要被檢測(cè)100次以上,不僅耗時(shí),還容易出現(xiàn)測(cè)序誤差累積的問(wèn)題。
而且數(shù)據(jù)分析部分,需要篩選出高頻突變位點(diǎn)、進(jìn)行致病性分析,這部分工作量極大,僅憑他們組現(xiàn)有的三個(gè)人,根本忙不過(guò)來(lái)。
“資源不夠可以向總部申請(qǐng)調(diào)配,但時(shí)間節(jié)點(diǎn)不能改?!?br>
王鵬敲了敲桌子,“華熙是我們的核心合作方,這次深度測(cè)序項(xiàng)目要是能做好,后續(xù)的臨床轉(zhuǎn)化合作就能敲定,對(duì)公司的業(yè)績(jī)至關(guān)重要。
田甜,這個(gè)項(xiàng)目就由你牽頭,陸承乾配合你,有什么需求可以首接跟我說(shuō)?!?br>
散會(huì)后,田甜和陸承乾留在會(huì)議室里梳理計(jì)劃。
“測(cè)序儀不夠是最大的問(wèn)題,我得向總部申請(qǐng)臨時(shí)調(diào)配一臺(tái)測(cè)序儀過(guò)來(lái),最好再派一個(gè)數(shù)據(jù)分析的專(zhuān)員幫忙?!?br>
田甜翻著筆記本,“另外,樣本質(zhì)量得嚴(yán)格把控,100例樣本,要是有幾例不合格,又得重新補(bǔ)測(cè),會(huì)耽誤更多時(shí)間。”
“我去對(duì)接樣本采集的事。”
陸承乾說(shuō),“華熙那邊的樣本是由他們的病理科提供,我去跟他們溝通,讓他們嚴(yán)格按要求處理樣本,避免運(yùn)輸過(guò)程中出現(xiàn)降解。
數(shù)據(jù)分析專(zhuān)員的事,我?guī)湍銌?wèn)問(wèn)總部的朋友,看看有沒(méi)有合適的人選。”
兩人聊得正投入,小柳推門(mén)進(jìn)來(lái),手里拿著一份樣本清單:“甜姐,陸哥,華熙那邊把100例樣本的清單發(fā)過(guò)來(lái)了,其中有20例是冰凍樣本,解凍后容易降解,咱們得盡快處理?!?br>
田甜接過(guò)清單,快速瀏覽一遍:“冰凍樣本優(yōu)先處理,今天下午就安排核酸提取,陸承乾,你明天去華熙對(duì)接的時(shí)候,順便把樣本接收單簽了,確認(rèn)樣本的保存狀態(tài)?!?br>
第二天一早,技術(shù)總監(jiān)空降研發(fā)部。
出乎所有人意料的是,新總監(jiān)竟然是田甜的大學(xué)師兄,林辰。
林辰穿著一身剪裁得體的西裝,褪去了學(xué)生時(shí)代的青澀,多了幾分職場(chǎng)精英的干練。
他走進(jìn)研發(fā)部,目光掃過(guò)眾人,最終落在田甜身上,笑著說(shuō):“甜甜,好久不見(jiàn),沒(méi)想到會(huì)在這里遇見(jiàn)你?!?br>
田甜愣了一下,隨即反應(yīng)過(guò)來(lái):“師兄?
你怎么會(huì)來(lái)蜀都生物?”
“我***做了三年的測(cè)序技術(shù)研發(fā),上個(gè)月剛回國(guó),剛好蜀都生物有這個(gè)職位,就過(guò)來(lái)了?!?br>
林辰笑著說(shuō),隨后收斂笑容,開(kāi)始主持會(huì)議,“我己經(jīng)了解了目前的項(xiàng)目情況,華熙的深度測(cè)序項(xiàng)目是重點(diǎn),我會(huì)協(xié)調(diào)總部調(diào)配一臺(tái)測(cè)序儀和一名數(shù)據(jù)分析專(zhuān)員過(guò)來(lái),一周內(nèi)到崗。
另外,我看了之前的實(shí)驗(yàn)記錄,發(fā)現(xiàn)咱們組在測(cè)序數(shù)據(jù)校準(zhǔn)方面有優(yōu)化空間,后續(xù)我會(huì)和大家一起完善流程?!?br>
林辰的到來(lái),讓田甜既意外又安心。
林辰在大學(xué)時(shí)就是測(cè)序技術(shù)方面的佼佼者,后來(lái)出國(guó)深造,技術(shù)能力更是毋庸置疑。
有他的幫助,深度測(cè)序項(xiàng)目的壓力無(wú)疑減輕了不少。
可陸承乾看著兩人熟絡(luò)的樣子,心里卻莫名有些不是滋味。
他不動(dòng)聲色地站在田甜身邊,接過(guò)林辰遞過(guò)來(lái)的項(xiàng)目?jī)?yōu)化方案:“林總監(jiān),我看了方案,關(guān)于數(shù)據(jù)校準(zhǔn)的部分,我有一些不同的想法,咱們可以私下溝通?!?br>
林辰看了陸承乾一眼,點(diǎn)點(diǎn)頭:“好,會(huì)后我們?cè)斦??!?br>
會(huì)后,林辰把田甜叫到辦公室:“甜甜,我知道這個(gè)項(xiàng)目壓力很大,有什么困難隨時(shí)跟我說(shuō)。
我***的時(shí)候,接觸過(guò)不少深度測(cè)序的項(xiàng)目,有一些經(jīng)驗(yàn)可以分享給你。
另外,我聽(tīng)說(shuō)你之前遇到了樣本被篡改的事,后續(xù)我會(huì)加強(qiáng)樣本庫(kù)的管理,避免再出現(xiàn)類(lèi)似的問(wèn)題?!?br>
“謝謝師兄?!?br>
田甜坐下來(lái)說(shuō),“目前最大的問(wèn)題就是時(shí)間緊、任務(wù)重,雖然總部會(huì)調(diào)配資源,但我還是擔(dān)心數(shù)據(jù)分析部分跟不上。”
“數(shù)據(jù)分析專(zhuān)員我己經(jīng)聯(lián)系好了,是我之前的同事,經(jīng)驗(yàn)很豐富,三天后就能到崗?!?br>
林辰說(shuō),“另外,我?guī)?lái)了一套新的數(shù)據(jù)分析算法,可以提高突變位點(diǎn)篩選的效率,我教你怎么用,能節(jié)省不少時(shí)間?!?br>
田甜心里一暖,沒(méi)想到林辰考慮得這么周到。
兩人聊了很久,從項(xiàng)目細(xì)節(jié)到職場(chǎng)發(fā)展,氣氛十分融洽。
而這一幕,恰好被來(lái)找田甜對(duì)接樣本事宜的陸承乾看到,他站在辦公室門(mén)口,握緊了手里的樣本清單,沉默片刻,轉(zhuǎn)身離開(kāi)了。
接下來(lái)的幾天,研發(fā)部進(jìn)入了全員加班模式。
新調(diào)配的測(cè)序儀和數(shù)據(jù)分析專(zhuān)員按時(shí)到崗,林辰帶來(lái)的新算法果然好用,數(shù)據(jù)分析的效率提高了近一倍。
田甜負(fù)責(zé)統(tǒng)籌整體進(jìn)度,把控樣本質(zhì)量和測(cè)序流程;陸承乾專(zhuān)注于測(cè)序儀的調(diào)試和數(shù)據(jù)校準(zhǔn),確保測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性;林辰則負(fù)責(zé)指導(dǎo)數(shù)據(jù)分析,解決遇到的技術(shù)難題。
可平靜的表面下,暗流涌動(dòng)。
陸承乾發(fā)現(xiàn),林辰對(duì)田甜格外照顧,不僅經(jīng)常單獨(dú)指導(dǎo)她,還每天給她帶早餐,兩人一起加班到深夜的次數(shù)也越來(lái)越多。
陸承乾心里的醋意越來(lái)越濃,工作中也難免有些分心,一次調(diào)試測(cè)序儀時(shí),不小心弄錯(cuò)了參數(shù),導(dǎo)致一批樣本的測(cè)序數(shù)據(jù)出現(xiàn)了輕微偏差。
“陸承乾,你怎么回事?”
田甜看著異常的數(shù)據(jù),語(yǔ)氣帶著幾分責(zé)備,“這批樣本己經(jīng)是第二次測(cè)序了,再出問(wèn)題,我們就真的趕不上時(shí)間節(jié)點(diǎn)了?!?br>
陸承乾低著頭,心里又愧疚又委屈:“對(duì)不起,是我走神了。
我會(huì)重新調(diào)試參數(shù),連夜重做的?!?br>
“我和你一起吧。”
田甜看著他疲憊的臉,語(yǔ)氣軟了下來(lái),“這段時(shí)間大家都很累,剛剛...是我太著急了。”
深夜的實(shí)驗(yàn)室里,只剩下田甜和陸承乾兩個(gè)人。
測(cè)序儀平穩(wěn)運(yùn)行著,發(fā)出輕微的嗡鳴。
陸承乾看著田甜認(rèn)真核對(duì)數(shù)據(jù)的樣子,輕聲說(shuō):“甜甜,我是不是……有點(diǎn)多余?”
田甜愣了一下,抬頭看向他:“你怎么會(huì)這么想?
這個(gè)項(xiàng)目離了你根本不行,測(cè)序數(shù)據(jù)的校準(zhǔn)全靠你,要是沒(méi)有你,我早就亂了陣腳了?!?br>
“可林總監(jiān)他……”陸承乾頓了頓,還是說(shuō)出了心里的想法,“他比我有能力,比我能幫到你,而且你們是師兄妹,關(guān)系那么好?!?br>
田甜看著陸承乾眼里的失落,心里突然一緊。
她這才意識(shí)到,陸承乾對(duì)自己的感情,不僅僅是同事和朋友。
她沉默片刻,輕聲說(shuō):“師兄只是我的前輩,他幫我是出于同門(mén)情誼。
而你,是我最信任的搭檔,不管是工作上還是生活上,你都給了我很多幫助。”
陸承乾的眼睛瞬間亮了起來(lái),他看著田甜,語(yǔ)氣帶著幾分試探:“甜甜,我……”就在這時(shí),測(cè)序儀突然發(fā)出了警報(bào)聲,打斷了兩人的對(duì)話(huà)。
田甜立刻湊過(guò)去看屏幕,臉色瞬間變了——測(cè)序儀的流動(dòng)槽出現(xiàn)了堵塞,導(dǎo)致測(cè)序中斷,而這批樣本,正是最關(guān)鍵的20例冰凍樣本。
另外,公司總部空降了一位技術(shù)總監(jiān),明天到崗,負(fù)責(zé)統(tǒng)籌所有研發(fā)項(xiàng)目?!?br>
會(huì)議室里瞬間安靜下來(lái),有人忍不住低聲抱怨:“100例樣本,兩周時(shí)間,還要做深度分析,這根本不可能完成??!
咱們組現(xiàn)在只有兩臺(tái)測(cè)序儀,滿(mǎn)負(fù)荷運(yùn)行也得三周才能做完測(cè)序?!?br>
田甜也皺起眉。
全外顯子組深度測(cè)序?qū)颖举|(zhì)量、儀器穩(wěn)定性和數(shù)據(jù)分析能力都有極高要求,100×的測(cè)序深度意味著每個(gè)堿基要被檢測(cè)100次以上,不僅耗時(shí),還容易出現(xiàn)測(cè)序誤差累積的問(wèn)題。
而且數(shù)據(jù)分析部分,需要篩選出高頻突變位點(diǎn)、進(jìn)行致病性分析,這部分工作量極大,僅憑他們組現(xiàn)有的三個(gè)人,根本忙不過(guò)來(lái)。
“資源不夠可以向總部申請(qǐng)調(diào)配,但時(shí)間節(jié)點(diǎn)不能改?!?br>
王鵬敲了敲桌子,“華熙是我們的核心合作方,這次深度測(cè)序項(xiàng)目要是能做好,后續(xù)的臨床轉(zhuǎn)化合作就能敲定,對(duì)公司的業(yè)績(jī)至關(guān)重要。
田甜,這個(gè)項(xiàng)目就由你牽頭,陸承乾配合你,有什么需求可以首接跟我說(shuō)?!?br>
散會(huì)后,田甜和陸承乾留在會(huì)議室里梳理計(jì)劃。
“測(cè)序儀不夠是最大的問(wèn)題,我得向總部申請(qǐng)臨時(shí)調(diào)配一臺(tái)測(cè)序儀過(guò)來(lái),最好再派一個(gè)數(shù)據(jù)分析的專(zhuān)員幫忙?!?br>
田甜翻著筆記本,“另外,樣本質(zhì)量得嚴(yán)格把控,100例樣本,要是有幾例不合格,又得重新補(bǔ)測(cè),會(huì)耽誤更多時(shí)間。”
“我去對(duì)接樣本采集的事。”
陸承乾說(shuō),“華熙那邊的樣本是由他們的病理科提供,我去跟他們溝通,讓他們嚴(yán)格按要求處理樣本,避免運(yùn)輸過(guò)程中出現(xiàn)降解。
數(shù)據(jù)分析專(zhuān)員的事,我?guī)湍銌?wèn)問(wèn)總部的朋友,看看有沒(méi)有合適的人選。”
兩人聊得正投入,小柳推門(mén)進(jìn)來(lái),手里拿著一份樣本清單:“甜姐,陸哥,華熙那邊把100例樣本的清單發(fā)過(guò)來(lái)了,其中有20例是冰凍樣本,解凍后容易降解,咱們得盡快處理?!?br>
田甜接過(guò)清單,快速瀏覽一遍:“冰凍樣本優(yōu)先處理,今天下午就安排核酸提取,陸承乾,你明天去華熙對(duì)接的時(shí)候,順便把樣本接收單簽了,確認(rèn)樣本的保存狀態(tài)?!?br>
第二天一早,技術(shù)總監(jiān)空降研發(fā)部。
出乎所有人意料的是,新總監(jiān)竟然是田甜的大學(xué)師兄,林辰。
林辰穿著一身剪裁得體的西裝,褪去了學(xué)生時(shí)代的青澀,多了幾分職場(chǎng)精英的干練。
他走進(jìn)研發(fā)部,目光掃過(guò)眾人,最終落在田甜身上,笑著說(shuō):“甜甜,好久不見(jiàn),沒(méi)想到會(huì)在這里遇見(jiàn)你?!?br>
田甜愣了一下,隨即反應(yīng)過(guò)來(lái):“師兄?
你怎么會(huì)來(lái)蜀都生物?”
“我***做了三年的測(cè)序技術(shù)研發(fā),上個(gè)月剛回國(guó),剛好蜀都生物有這個(gè)職位,就過(guò)來(lái)了?!?br>
林辰笑著說(shuō),隨后收斂笑容,開(kāi)始主持會(huì)議,“我己經(jīng)了解了目前的項(xiàng)目情況,華熙的深度測(cè)序項(xiàng)目是重點(diǎn),我會(huì)協(xié)調(diào)總部調(diào)配一臺(tái)測(cè)序儀和一名數(shù)據(jù)分析專(zhuān)員過(guò)來(lái),一周內(nèi)到崗。
另外,我看了之前的實(shí)驗(yàn)記錄,發(fā)現(xiàn)咱們組在測(cè)序數(shù)據(jù)校準(zhǔn)方面有優(yōu)化空間,后續(xù)我會(huì)和大家一起完善流程?!?br>
林辰的到來(lái),讓田甜既意外又安心。
林辰在大學(xué)時(shí)就是測(cè)序技術(shù)方面的佼佼者,后來(lái)出國(guó)深造,技術(shù)能力更是毋庸置疑。
有他的幫助,深度測(cè)序項(xiàng)目的壓力無(wú)疑減輕了不少。
可陸承乾看著兩人熟絡(luò)的樣子,心里卻莫名有些不是滋味。
他不動(dòng)聲色地站在田甜身邊,接過(guò)林辰遞過(guò)來(lái)的項(xiàng)目?jī)?yōu)化方案:“林總監(jiān),我看了方案,關(guān)于數(shù)據(jù)校準(zhǔn)的部分,我有一些不同的想法,咱們可以私下溝通?!?br>
林辰看了陸承乾一眼,點(diǎn)點(diǎn)頭:“好,會(huì)后我們?cè)斦??!?br>
會(huì)后,林辰把田甜叫到辦公室:“甜甜,我知道這個(gè)項(xiàng)目壓力很大,有什么困難隨時(shí)跟我說(shuō)。
我***的時(shí)候,接觸過(guò)不少深度測(cè)序的項(xiàng)目,有一些經(jīng)驗(yàn)可以分享給你。
另外,我聽(tīng)說(shuō)你之前遇到了樣本被篡改的事,后續(xù)我會(huì)加強(qiáng)樣本庫(kù)的管理,避免再出現(xiàn)類(lèi)似的問(wèn)題?!?br>
“謝謝師兄?!?br>
田甜坐下來(lái)說(shuō),“目前最大的問(wèn)題就是時(shí)間緊、任務(wù)重,雖然總部會(huì)調(diào)配資源,但我還是擔(dān)心數(shù)據(jù)分析部分跟不上。”
“數(shù)據(jù)分析專(zhuān)員我己經(jīng)聯(lián)系好了,是我之前的同事,經(jīng)驗(yàn)很豐富,三天后就能到崗?!?br>
林辰說(shuō),“另外,我?guī)?lái)了一套新的數(shù)據(jù)分析算法,可以提高突變位點(diǎn)篩選的效率,我教你怎么用,能節(jié)省不少時(shí)間?!?br>
田甜心里一暖,沒(méi)想到林辰考慮得這么周到。
兩人聊了很久,從項(xiàng)目細(xì)節(jié)到職場(chǎng)發(fā)展,氣氛十分融洽。
而這一幕,恰好被來(lái)找田甜對(duì)接樣本事宜的陸承乾看到,他站在辦公室門(mén)口,握緊了手里的樣本清單,沉默片刻,轉(zhuǎn)身離開(kāi)了。
接下來(lái)的幾天,研發(fā)部進(jìn)入了全員加班模式。
新調(diào)配的測(cè)序儀和數(shù)據(jù)分析專(zhuān)員按時(shí)到崗,林辰帶來(lái)的新算法果然好用,數(shù)據(jù)分析的效率提高了近一倍。
田甜負(fù)責(zé)統(tǒng)籌整體進(jìn)度,把控樣本質(zhì)量和測(cè)序流程;陸承乾專(zhuān)注于測(cè)序儀的調(diào)試和數(shù)據(jù)校準(zhǔn),確保測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性;林辰則負(fù)責(zé)指導(dǎo)數(shù)據(jù)分析,解決遇到的技術(shù)難題。
可平靜的表面下,暗流涌動(dòng)。
陸承乾發(fā)現(xiàn),林辰對(duì)田甜格外照顧,不僅經(jīng)常單獨(dú)指導(dǎo)她,還每天給她帶早餐,兩人一起加班到深夜的次數(shù)也越來(lái)越多。
陸承乾心里的醋意越來(lái)越濃,工作中也難免有些分心,一次調(diào)試測(cè)序儀時(shí),不小心弄錯(cuò)了參數(shù),導(dǎo)致一批樣本的測(cè)序數(shù)據(jù)出現(xiàn)了輕微偏差。
“陸承乾,你怎么回事?”
田甜看著異常的數(shù)據(jù),語(yǔ)氣帶著幾分責(zé)備,“這批樣本己經(jīng)是第二次測(cè)序了,再出問(wèn)題,我們就真的趕不上時(shí)間節(jié)點(diǎn)了?!?br>
陸承乾低著頭,心里又愧疚又委屈:“對(duì)不起,是我走神了。
我會(huì)重新調(diào)試參數(shù),連夜重做的?!?br>
“我和你一起吧。”
田甜看著他疲憊的臉,語(yǔ)氣軟了下來(lái),“這段時(shí)間大家都很累,剛剛...是我太著急了。”
深夜的實(shí)驗(yàn)室里,只剩下田甜和陸承乾兩個(gè)人。
測(cè)序儀平穩(wěn)運(yùn)行著,發(fā)出輕微的嗡鳴。
陸承乾看著田甜認(rèn)真核對(duì)數(shù)據(jù)的樣子,輕聲說(shuō):“甜甜,我是不是……有點(diǎn)多余?”
田甜愣了一下,抬頭看向他:“你怎么會(huì)這么想?
這個(gè)項(xiàng)目離了你根本不行,測(cè)序數(shù)據(jù)的校準(zhǔn)全靠你,要是沒(méi)有你,我早就亂了陣腳了?!?br>
“可林總監(jiān)他……”陸承乾頓了頓,還是說(shuō)出了心里的想法,“他比我有能力,比我能幫到你,而且你們是師兄妹,關(guān)系那么好?!?br>
田甜看著陸承乾眼里的失落,心里突然一緊。
她這才意識(shí)到,陸承乾對(duì)自己的感情,不僅僅是同事和朋友。
她沉默片刻,輕聲說(shuō):“師兄只是我的前輩,他幫我是出于同門(mén)情誼。
而你,是我最信任的搭檔,不管是工作上還是生活上,你都給了我很多幫助。”
陸承乾的眼睛瞬間亮了起來(lái),他看著田甜,語(yǔ)氣帶著幾分試探:“甜甜,我……”就在這時(shí),測(cè)序儀突然發(fā)出了警報(bào)聲,打斷了兩人的對(duì)話(huà)。
田甜立刻湊過(guò)去看屏幕,臉色瞬間變了——測(cè)序儀的流動(dòng)槽出現(xiàn)了堵塞,導(dǎo)致測(cè)序中斷,而這批樣本,正是最關(guān)鍵的20例冰凍樣本。